|
|
|
Hankekoodi: A70298
Hankkeen nimi: INKA - Digitaaliset biopankit
Toimintalinja: 2. Uusimman tiedon ja osaamisen tuottaminen ja hyödyntäminen
Erityistavoite: 4.1. Tutkimus-, osaamis- ja innovaatiokeskittymien kehittäminen alueellisten vahvuuksien pohjalta
Suunnitelman mukainen toteutusaika: Alkaa 1.4.2015 ja päättyy 31.5.2017
Toiminnan tila: Toiminta päättynyt
Vastuuviranomainen: Innovaatiorahoituskeskus Business Finland
Hakijan virallinen nimi: Oulun Yliopisto
Organisaatiotyyppi: Yliopisto
Y-tunnus: 0245895-5
Jakeluosoite: PL 8000
Puhelinnumero: 553 1011
Postinumero: 90014
Postitoimipaikka: OULUN YLIOPISTO
WWW-osoite: www.oulu.fi/yliopisto/
Hankkeen yhteyshenkilön nimi: Keskinarkaus, Anja
Yhteyshenkilön asema hakijaorganisaatiossa: N/A
Yhteyshenkilön sähköpostisoite: anja.keskinarkaus(at)ee.oulu.fi
Yhteyshenkilön puhelinnumero: +358405833116
Hakijoiden lukumäärä tai tuen siirto -menettely:
Biopankkimateriaalia, erityisesti patologian mittavia kudosarkistoja, on kerätty vuosikymmeniä. Digitalisoitumisen ja jalostamisen myötä aineisto tarjoaa huikeat tutkimus- ja liiketoimintamahdollisuudet eri toimijoille kokonaan uusien hoitomuotojen, täsmälääkkeiden ja palvelujen alueella. Tallentamalla, jalostamalla ja louhimalla suurtietomääriä on mahdollista muuntaa yhä suurempi osa potilaiden hoitoa sairauden hoidosta ennakoivaan hoitoon.
Biopankkinäytteisiin liittyvä tutkimus on poikkitieteellistä, mikä hyödyntää sekä biolääketieteen että IT-alan tutkijoita ja avaa uusia näkökulmia tutkimusprojekteihin. Laiteriippumattomien kuvien analysointialgoritmien ja suurtietomäärien säilytys- ja louhintatyökalujen kehittäminen on oma tutkimusalueensa, jonka käyttömahdollisuuksia on muuallakin kuin lääke- ja biotieteissä. Patologian kudosmateriaalit tarjoavat kuitenkin yhden haastavimmista kentistä hahmontunnistukselle ja konenäön ratkaisuille. Hahmontunnistuksella voitaisiin löytää esimerkiksi syöpäkudoksesta tiettyjä rakenteita, joiden avulla pystyttäisiin löytämään relevantti aineisto lääketieteelliseen tutkimukseen. Mielenkiintoinen olisi myös mahdollisuus löytää uusia rakenteellisia tai molekyylipatologisia merkkejä vielä tuntemattomista potilaiden ennusteeseen vaikuttavista seikoista.
Oulun yliopiston EAKR-hanke ’Digitaaliset biopankit’ samaan aiheeseen liittyvine rinnakkaishankkeineen on osa kansallisen INKA (Innovatiiviset kaupungit) -ohjelman ‘tulevaisuuden terveys’ -teemaa, jonka tarkoituksena on synnyttää kilpailukykyä, tehokkuutta ja uutta liiketoimintaa terveydenhuollon sektorille. Hankkeessa keskeistä on uusimpien ICT teknologioiden hyödyntäminen mukaan lukien Big data, tietoturva, standardoitu ja laadukas tallennus, hahmontunnistus ja kuva-analyysit, digitaalinen automaatio, työkalut heikkojen ilmiöiden tunnistamiseen ja tiedonlouhintaan, minkä avulla pystytään muodostamaan palvelukyvykkyyksiä ja luomaan ketteriä sovelluksia.
Myönnetty EU- ja valtion rahoitus: 450 000
Toteutunut EU- ja valtion rahoitus: 443 540
Suunniteltu julkinen rahoitus yhteensä: 486 625
Toteutunut julkinen rahoitus yhteensä: 478 822
Hankkeen toiminta on valtakunnallista
Jakeluosoite: Oulun yliopisto, Linnanmaan kampus
Postinumero: 90014
Postitoimipaikka: Oulu
Suunniteltu: 3, joihin työllistyvät naiset 2
Toteutunut seurantatietojen mukaan: 0.00, joihin työllistyvät naiset 0.00
Suunniteltu: 0, joista naisten perustamia 0
Toteutunut seurantatietojen mukaan: 0.00, joista naisten perustamia 0.00
| Välitön | Välillinen | |
| Ekologinen kestävyys | ||
| Luonnonvarojen käytön kestävyys | 0 | 3 |
| Hyvin organisoitu näytekeräys ja -säilytys sekä tietojen sähköinen siirto säästää resursseja, mikä heijastuu myös luonnonvarojen säästöön | ||
| Ilmastonmuutoksen aiheuttamien riskien vähentäminen | 0 | 2 |
| Hyvin organisoitu näytekeräys ja -säilytys sekä tietojen sähköinen siirto fyysisten näytteiden sijasta säästää resursseja, mikä hillitsee myös ilmastonmuutosta | ||
| Kasvillisuus, eliöt ja luonnon monimuotoisuus | 0 | 0 |
| Ei vaikutusta | ||
| Pinta- ja pohjavedet, maaperä sekä ilma (ja kasvihuonekaasujen väheneminen) | 0 | 0 |
| Ei vaikutusta | ||
| Natura 2000 -ohjelman kohteet | 0 | 0 |
| Ei vaikutusta | ||
| Taloudellinen kestävyys | ||
| Materiaalit ja jätteet | 6 | 5 |
| Hyvin organisoituun näytekeräykseen ja -säilytykseen kuuluu tehostettu materiaalien käyttö ja jätehyolto. Biopankkimateriaalin digitalisoituminen vähentää päällekkäistä laboratoriotyötä. | ||
| Uusiutuvien energialähteiden käyttö | 0 | 0 |
| Ei vaikutusta | ||
| Paikallisen elinkeinorakenteen kestävä kehittäminen | 9 | 9 |
| Digitaaliset biopankkimateriaalit ja niihin kehittettävät palvelut ja työkalut mahdollistavat innovaatiota sekä tutkimuslaitoksille että yrityksille. Oulun alueella biolääketieteen ja ICT-tutkimuksen yhdistämiselle erityisen hedelmällinen maaperä. | ||
| Aineettomien tuotteiden ja palvelujen kehittäminen | 9 | 9 |
| Digitaalisoinnin avulla muodostetaan Digitaalinen biopankki palveluna -konsepti, jossa uusien työkalujen avulla saadaan uutta tutkimustietoa suurtietomäätiä älykkäästi louhimalla. | ||
| Liikkuminen ja logistiikka | 5 | 5 |
| Biopankkimateriaalin digitalisointi mahdolllistaa sekä tutkimus- että diagnostisten aineistojen käytön tehokkaasti välimatkoista riippumatta. | ||
| Sosiaalinen ja kulttuurinen kestävyys sekä yhdenvertaisuus | ||
| Hyvinvoinnin edistäminen | 7 | 10 |
| Uusien diagnostisten ja hoitomenetelmien kehitys biopankkimateriaalin ja hankkeessa kehitettävien uusien analyysi- ja louhintamenetelmien sekä -palvelujen avulla tulee pitkällä tähtäimellä parantamaan kansanterveyttä. | ||
| Tasa-arvon edistäminen | 0 | 0 |
| Ei vaikutusta | ||
| Yhteiskunnallinen ja kulttuurinen yhdenvertaisuus | 0 | 5 |
| Biopankkimateriaalin digitalisointi mahdolllistaa sekä tutkimus- että diagnostisten aineistojen käytön tehokkaasti välimatkoista riippumatta, millä on positiivinen vaikutus esim patologipulasta kärsivien syrjäseutujen asukkaiden hoitoon. | ||
| Kulttuuriympäristö | 0 | 0 |
| Ei vaikutusta | ||
| Ympäristöosaaminen | 0 | 0 |
| Ei vaikutusta | ||
Biopankkimateriaalia, erityisesti patologian mittavia kudosarkistoja, on kerätty vuosikymmeniä. Digitalisoitumisen ja jalostamisen myötä aineisto tarjoaa huikeat tutkimus- ja liiketoimintamahdollisuudet eri toimijoille kokonaan uusien hoitomuotojen, täsmälääkkeiden ja palvelujen alueella. Tallentamalla, jalostamalla ja louhimalla suurtietomääriä on mahdollista muuntaa yhä suurempi osa potilaiden hoitoa sairauden hoidosta ennakoivaan hoitoon.
Biopankkinäytteisiin liittyvä tutkimus on poikkitieteellistä, mikä hyödyntää sekä biolääketieteen että IT-alan tutkijoita ja avaa uusia näkökulmia tutkimusprojekteihin. Laiteriippumattomien kuvien analysointialgoritmien ja suurtietomäärien säilytys- ja louhintatyökalujen kehittäminen on oma tutkimusalueensa, jonka käyttömahdollisuuksia on muuallakin kuin lääke- ja biotieteissä. Patologian kudosmateriaalit tarjoavat kuitenkin yhden haastavimmista kentistä hahmontunnistukselle ja konenäön ratkaisuille. Hahmontunnistuksella voitaisiin löytää esimerkiksi syöpäkudoksesta tiettyjä rakenteita, joiden avulla pystyttäisiin löytämään relevantti aineisto lääketieteelliseen tutkimukseen. Mielenkiintoinen olisi myös mahdollisuus löytää uusia rakenteellisia tai molekyylipatologisia merkkejä vielä tuntemattomista potilaiden ennusteeseen vaikuttavista seikoista.
Oulun yliopiston EAKR-hanke ’Digitaaliset biopankit’ samaan aiheeseen liittyvine rinnakkaishankkeineen on osa kansallisen INKA (Innovatiiviset kaupungit) -ohjelman ‘tulevaisuuden terveys’ -teemaa, jonka tarkoituksena on synnyttää kilpailukykyä, tehokkuutta ja uutta liiketoimintaa terveydenhuollon sektorille. Hankkeessa keskeistä on uusimpien ICT teknologioiden hyödyntäminen mukaan lukien Big data, tietoturva, standardoitu ja laadukas tallennus, hahmontunnistus ja kuva-analyysit, digitaalinen automaatio, työkalut heikkojen ilmiöiden tunnistamiseen ja tiedonlouhintaan, minkä avulla pystytään muodostamaan palvelukyvykkyyksiä ja luomaan ketteriä sovelluksia.